Η λίμνη Βιστωνίδα αποτελεί μια υγροτοπική ενότητα με τη λιμνοθάλασσσα του Πόρτο Λάγος με την οποία συνδέεται με στόμια μεταφοράς νερού, ενώ με τη θάλασσα χωρίζεται με μια στενή λωρίδα γης. Το βόρειο τμήμα της λίμνης έχει γλυκό νερό, καθώς εκβάλλουν τρία μικρά ποτάμια, ο Κόσυνθος, ο Κομψάτος και ο Τραύος. Το νότιο τμήμα της είναι υφάλμυρο από το θαλάσσιο νερό που μπαίνει από το Πόρτο Λάγος. Η διαφορά αλατότητας του νερού αποτελεί ιδανικό περιβάλλον για την ύπαρξη ποικιλίας ψαριών. Στην παράκτια ζώνη της λίμνης και στις ελώδεις περιοχές της υπάρχει πλούσια χλωρίδα με παραποτάμια δάση, λιβάδια, θάμνους και καλαμιώνες, όπου διαμένουν πολλά είδη πουλιών, διάφορα θηλαστικά, ερπετά και αμφίβια. Η Βιστωνίδα φημίζεται για την ορνιθοπανίδα της. Υπάρχουν 260 είδη πουλιών από τα οποία τα εννιά είναι σπάνια ή απειλούμενα σε διεθνές επίπεδο, όπως το κεφαλούδι, η λεπτομύτη, η χαλκόκοτα και η νανόχηνα. Στη λίμνη μπορούμε να δούμε αρκετά είδη ερωδιών, στη βόρεια περιοχή των γλυκών νερών, πορφυροτσικνιάδες, κρυπτοτσικνιάδες και νυχτοκόρακες, ενώ στη νότια περιοχή με τα υφάλμυρα νερά αργυροτσικνιάδες, σταχτοτσικνιάδες, λευκοτσικνιάδες, κορμοράνους και άλλα παρυδάτια και υδρόβια πουλιά.